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Chemitorium, creare e visualizzare molecole in 3D

 
Angelo Iasevoli
21 Aprile 2010
10 commenti

La chimica è una delle materie per certi versi più difficile. Diversamente dalla fisica meccanica che da la possibilità di visualizzare almeno mentalmente cosa accade se lasciamo cadere una palla, oppure facciamo scivolare un mattone su un piano inclinato, la chimica ci permette solo lontanamente di immaginare cosa succede nel macroscopico, e tutto è tranne che intuitivo. Insomma, si sa benissimo che si ha a che fare con leggi differenti da quelle che siamo abituati a vivere nel quotidiano.

Con questa prefazione, voglio dire che le cose diventano più semplici quando riusciamo a vederle. Mentre un mattone che scivola è facilmente scrutabile, una molecola d’acqua è decisamente molto più difficile da vedere (usando un eufemismo). Eppure guardando la geometria molecolare, riusciremo a capire molte cose del microscopico. Ad esempio che gli atomi che compongono una molecola aventi stessa carica tentano di mantenere la maggior distanza possibile tra loro (esempio: molecola di metano che ha forma di tetraedro).


Ci serve quindi qualche strumento che ci aiuti a capire questo mondo microscopico, ed è proprio quello che voglio presentarvi oggi. Si tratta di Chemitorium, un software freeware che vi permetterà di dare uno sguardo alle molecole a distanza ravvicinata, in modo da farvi capire come sono fatte (ovviamente anche quelle sono approssimazioni).

Potrete inserire gli atomi che compongono la molecola e collegarli tra di loro con dei legami fino a darle una forma molecolare. Potremo poi visualizzare la molecola in 3D e ruotarla a piacimento. Avremo anche la possibilità di registrare un video in cui la molecola ruota su se stessa.

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Commento

  • #1Sax

    wow grazie! davvero non so da quanto tempo cercavo un programma come questo!

    21 Apr 2010, 2:13 pm Rispondi|Quota
  • #2davide

    grazie:'( grazie mille!!! sono commosso… tra pochi giorni ho l'esame di chimica organica e mi sarà di fondamentale aiuto questo programma!!^^

    21 Apr 2010, 3:26 pm Rispondi|Quota
    • #3Angelo Iasevoli

      io ho la prova intercorso :S

      21 Apr 2010, 3:36 pm Rispondi|Quota
  • #4monster16

    era da molto tempo che cercavo un programma free del genere. grazie mille

    21 Apr 2010, 3:32 pm Rispondi|Quota
  • #5Angelo

    uhm, con windows 7 non funziona, mi crasha appena cerco di farlo partire! Stranissimo… ho anche provato ad eseguirlo in modalita' "compatibile XP SP3", niente da fare.

    21 Apr 2010, 7:03 pm Rispondi|Quota
  • #6andrea

    ho un problema : quando clicco su 3D VIEW appare una finestra di errore che dice :
    ERROR InvalidCallException
    ———————
    Errore dell'applicazione.
    ———————
    Microsoft.DirectX.Direct3D.InvalidCallException
    in Microsoft.DirectX.Direct3D.Device..ctor(Int32 adapter, DeviceType deviceType, Control renderWindow, CreateFlags behaviorFlags, PresentParameters[] presentationParameters)

    in Program.View3D.CreateDevice()

    in Program.View3D.Run(Object o)
    COSA POSSO FARE ( ho vista)

    22 Apr 2010, 12:12 pm Rispondi|Quota
    • #7matt425

      a me succede quando gli metto delle molecole troppo grandi da renderizzare in alta qualità. prova a visualizzare una molecola piccola e poi prova a togliere l'opzione "render in high quality" quando stai in 3d view

      27 Apr 2010, 5:42 pm Rispondi|Quota
  • #8Anonimo

    Come si fanno i legami?

    22 Apr 2010, 1:15 pm Rispondi|Quota
    • #9matt425

      con il tasto destro, se premi shift ti fa anche i legami doppi

      27 Apr 2010, 5:42 pm Rispondi|Quota
  • #10lorenzo

    Come si salvano i video? me li salva ma poi nn riesco a vederli sara il fatto che compressa i fotogrammi?

    19 Mar 2012, 5:26 pm Rispondi|Quota